控制和降低冷库的经营成本，在机器设备的运行管理中，要围绕"油、氟、水、电"做文章；在库房管理中，要严把"冰、霜、水、门、灯"五关；在质量管理中，采用先进工艺和技术，提高产品质量。如何降低冷库的运营成本？
压缩机冷量过大
库房负荷减小后，未及时减少压缩机的能量。冷库的压缩机是根据制冷系统负荷匹配的，而果蔬冷库的负荷是发生在货物入库阶段，其它大多数时间，压缩机的负荷不足50%。当入库结束温度降至适宜贮藏温度以后，系统负荷大大减少，如仍开启较大的机器，这样便形成了大马拉小车，温差增大，耗电量增大。
应根据库房负荷的变化减少压缩机开启台数或用能量调节装置减少工作缸数。
有些设计单位及个别的设计人员，由于对冷库防潮隔气保温层的认识存在一些误区，从设计开始就对冷库工程的工作原理以及外部环境的影响存在糊涂认识，认为防水隔气层做与不做，对保温效果影响不大，更有甚者认为做与不做，选用什么材料做没有太大差别，因此设计这一关，把关不到位。
果蔬存放在小型冷库之后，那么就会长时间受到低氧的作用。虽然出库后低氧状态解除，但果蔬依然会在较长一段时间内出现滞后的现象，这样就可以实现果蔬货架期的延长，从而实现经济收益的提高。相关实验数据表明：在相同质量的前提下，将果蔬放入在小型冷库中存放，那么货架期可以有效的延长2到3倍。