常用的冷却方法有：
①空气冷却法，通风冷吹向放置食品的隧道，或用1300～2000Pa的压差，使冷空气进入并穿过有气窗的食品包装箱，以加速产品的冷却。冷空气的温度、相对湿度和流速根据食品的种类确定，一般不使食品冻结，相对湿度常为90～95%。
②水冷却法，以水为热传导介质,用大容量的水泵使接近0℃的冷水喷洒在产品上。因水的热容量比空气大得多，传热效率高，大部分食品可在10～15分钟内冷却。用海水冷却鱼类时，速度快,温度均匀，且可延长保藏期。
压缩机冷量过大
库房负荷减小后，未及时减少压缩机的能量。冷库的压缩机是根据制冷系统负荷匹配的，而果蔬冷库的负荷是发生在货物入库阶段，其它大多数时间，压缩机的负荷不足50%。当入库结束温度降至适宜贮藏温度以后，系统负荷大大减少，如仍开启较大的机器，这样便形成了大马拉小车，温差增大，耗电量增大。
应根据库房负荷的变化减少压缩机开启台数或用能量调节装置减少工作缸数。
有些冷库安装公司采用现场喷涂聚氨酯泡沫隔热材料，却不设置隔气防潮层，甚至某些冷库砌体后连水泥砂浆都不抹，直接喷涂聚氨酯发泡层，他们错误的认为硬泡会自结皮，岂不知每次喷涂都把上一层的结皮破坏，冷热水蒸汽基本在没有阻隔的情况下，长驱直入使保温层受到严重破坏，库温相当不稳定，给冷库的运转带来极大困难。
除了品质和时间符合果蔬冷库安装企业的需求，货架期的延长是使用果蔬冷库的另一大特别优势。所谓货架期就是果蔬从小型冷库拿出之后，放在货架上的一些时间。对于经营者来说，货架期也是一个非常重要的指标，如果没有满足货架期，那么这种商品其实也具有一定的危险性，也会使得自己的经营受到一定的影响。