控制和降低冷库的经营成本，在机器设备的运行管理中，要围绕"油、氟、水、电"做文章；在库房管理中，要严把"冰、霜、水、门、灯"五关；在质量管理中，采用先进工艺和技术，提高产品质量。如何降低冷库的运营成本？
蒸发温度与库房温度的温差增大，就会使蒸发温度过低，这会导致制冷系数下降，能耗增加。据估算，在其他条件不变的情况下，当蒸发温度每降低1℃，则要多耗电1~2%。另外，温差增大，还会使冷风机的除湿量增大，库房湿度减小，从而引起食品干耗增大，食品品质下降。
有些冷库安装公司采用现场喷涂聚氨酯泡沫隔热材料，却不设置隔气防潮层，甚至某些冷库砌体后连水泥砂浆都不抹，直接喷涂聚氨酯发泡层，他们错误的认为硬泡会自结皮，岂不知每次喷涂都把上一层的结皮破坏，冷热水蒸汽基本在没有阻隔的情况下，长驱直入使保温层受到严重破坏，库温相当不稳定，给冷库的运转带来极大困难。
跟其他类型冷库一样，货物放入小型冷库之后，其新鲜品质得以较长时间地有效保持。例如，果蔬保鲜冷库中储存的水果蔬菜在稳定适宜的低温环境下，其呼吸作用及新陈代谢速度减缓，从而保鲜较长时间。