常用的冷却方法有：
①空气冷却法，通风冷吹向放置食品的隧道，或用1300～2000Pa的压差，使冷空气进入并穿过有气窗的食品包装箱，以加速产品的冷却。冷空气的温度、相对湿度和流速根据食品的种类确定，一般不使食品冻结，相对湿度常为90～95%。
②水冷却法，以水为热传导介质,用大容量的水泵使接近0℃的冷水喷洒在产品上。因水的热容量比空气大得多，传热效率高，大部分食品可在10～15分钟内冷却。用海水冷却鱼类时，速度快,温度均匀，且可延长保藏期。
蒸发温度与库房温度的温差增大，就会使蒸发温度过低，这会导致制冷系数下降，能耗增加。据估算，在其他条件不变的情况下，当蒸发温度每降低1℃，则要多耗电1~2%。另外，温差增大，还会使冷风机的除湿量增大，库房湿度减小，从而引起食品干耗增大，食品品质下降。
压缩机冷量过大
库房负荷减小后，未及时减少压缩机的能量。冷库的压缩机是根据制冷系统负荷匹配的，而果蔬冷库的负荷是发生在货物入库阶段，其它大多数时间，压缩机的负荷不足50%。当入库结束温度降至适宜贮藏温度以后，系统负荷大大减少，如仍开启较大的机器，这样便形成了大马拉小车，温差增大，耗电量增大。
应根据库房负荷的变化减少压缩机开启台数或用能量调节装置减少工作缸数。
跟其他类型冷库一样，货物放入小型冷库之后，其新鲜品质得以较长时间地有效保持。例如，果蔬保鲜冷库中储存的水果蔬菜在稳定适宜的低温环境下，其呼吸作用及新陈代谢速度减缓，从而保鲜较长时间。